Elie Le Quemener
LE QUEMENER Elie
Chargé de Recherche
Dpt. MICA

Également appelé
Elie DESMOND
Elie DESMOND-LE QUEMENER

Activités - Fonctions

Objet thématique de rattachement : SAMI

Modélisation des interactions biotiques dans des écosystèmes microbiens

Mots Clés : 

  • Modélisation des écosystèmes microbiens dans les bioprocédés environnementaux
  • Thermodynamique microbienne
  • Transfert d'électrons inter-espèces
  • Systèmes électrochimiques microbiens pour la bioraffinerie environnementale
  • Écologie, diversité et évolution microbiennes

Projets

  • LeAD (2025-2029) : Leveraging Anaerobic Digestion through environmental stresses. Europe MSCA Doctoral Network.
  • ElectoMIC (2023-2028) : Electrochemically-assisted MICrobial community metabolic network optimization for biorefinery of organic waste. PEPR B-BEST.
  • MODOSAO (2023-2026) : MODèles métaboliques sous contraintes thermodynamiques pour la modélisation de l'Oxydation Syntrophique des Acides Organiques dans la digestion anaérobie. Thèse INRAE.

Parcours scientifique

  • Séjour sabbatique à Arizona State University, Swette Center for Environmental Biotechnology (Arizona State University), Tempe, USA (2019).
  • Chargé de recherche INRAE depuis 2016
  • Post-doctorat à IRSTEA, à Antony (2010-2016)
  • Doctorat à l'institut pasteur, laboratoire BMGE, à Paris (2006-2009)
  • Master 2 "interface physique-biologie", à Paris VII et XI (2005-2006)
  • École normale supérieure de Lyon (2002-2006)

Publications récentes

https://cv.hal.science/elie-desmond-lequemener
https://orcid.org/0000-0003-1675-2744
https://www.researchgate.net/profile/Elie-Desmond-Le-Quemener

  • Pérez-Bernal M. F., Berthomieu R., Desmond-Le Quéméner E., Bernet N., Trably E. (2024). Influence of fumarate on interspecies electron transfer and the metabolic shift induced in Clostridium pasteurianum by Geobacter sulfurreducens. Journal of Applied Microbiology, 135 (5), lxae122, https://dx.doi.org/10.1093/jambio/lxae122
  • Lanfranchi A., Desmond-Le Quéméner E., Magdalena J., Cavinato C., Trably E. (2024). Conversion of wine lees and waste activated sludge into caproate and heptanoate: Thermodynamic and microbiological insights. Bioresource Technology, 131126, https://doi.org/10.1016/j.biortech.2024.131126
  • Rous A., Santa-Catalina G., Desmond-Le Quéméner E., Trably E., Bernet N. (2024). Comparison of enrichment methods for efficient nitrogen fixation on a biocathode. Peer Community Journal, 4, e12, https://dx.doi.org/10.24072/pcjournal.365
  • Katipoglu-Yazan T., Dev S., Desmond-Le Quéméner E., Bouchez T. (2023). Data on the influence of temperature on the growth of Escherichia coli in a minimal medium containing glucose as the sole carbon source for the joint computation of growth yields and rates at each temperature from 27 to 45°C. Data in Brief, 48, 109037, https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2023.109037
  • Tian J.-H., Lacroix R., Yaqoob A. A., Bureau C., Midoux C., Desmond-Le Quéméner E., Bouchez T. (2023). Study of a Pilot Scale Microbial Electrosynthesis Reactor for Organic Waste Biorefinery. Energies, 16 (2), 591, https://dx.doi.org/10.3390/en16020591
  • Thomas C., Desmond-Le Quéméner E., Gribaldo S., Borrel G. (2022). Factors shaping the abundance and diversity of the gut archaeome across the animal kingdom. Nature Communications, 13 (1), 3358, https://dx.doi.org/10.1038/s41467-022-31038-4
  • Berthomieu R., Pérez-Bernal M. F., Santa-Catalina G., Desmond-Le Quéméner E., Bernet N., Trably E. (2022). Mechanisms underlying Clostridium pasteurianum’s metabolic shift when grown with Geobacter sulfurreducens. Applied Microbiology and Biotechnology, 106 (2), 865-876, https://dx.doi.org/10.1007/s00253-021-11736-7
  • Haidar I., Desmond-Le Quéméner E., Barbot J.-P., Harmand J., Rapaport A. (2022). Modelling and optimal control of an electro-fermentation process within a batch culture. Processes, 10 (3), https://dx.doi.org/10.3390/pr10030535
  • Desmond-Le Quéméner E., Moscoviz R., Bernet N., Marcus A. (2021). Modeling of interspecies electron transfer in anaerobic microbial communities. Current Opinion in Biotechnology, 67, 49-57, https://dx.doi.org/10.1016/j.copbio.2020.12.019
  • Ugalde-Salas P., Ramírez C. H., Harmand J., Desmond-Le Quéméner E. (2021). Microbial Interactions as Drivers of a Nitrification Process in a Chemostat. Bioengineering, 8 (3), 31, https://dx.doi.org/10.3390/bioengineering8030031
  • Ouazaite H., Milferstedt K., Hamelin J., Desmond‐Le Quéméner E. (2021). Mapping the biological activities of filamentous oxygenic photogranules. Biotechnology and Bioengineering, 118 (2), 601-611, https://dx.doi.org/10.1002/bit.27585